Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGIRP43119 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms