Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPOP42166 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPOP42166 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPOP42166 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPOP42166 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMPOP42166 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMPOP42166 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMPOP42166 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMPOP42166 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMPOP42166 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPOP42166 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPOP42166 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPOP42166 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms