Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms