Protein–RNA interactions for Protein: P40197

GP5, Platelet glycoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP5P40197 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP5P40197 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP5P40197 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP5P40197 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP5P40197 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP5P40197 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP5P40197 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP5P40197 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP5P40197 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GP5P40197 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GP5P40197 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms