Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA7P36544 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms