Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FLT4P35916 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FLT4P35916 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FLT4P35916 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FLT4P35916 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FLT4P35916 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FLT4P35916 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FLT4P35916 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FLT4P35916 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FLT4P35916 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FLT4P35916 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FLT4P35916 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FLT4P35916 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FLT4P35916 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FLT4P35916 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FLT4P35916 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FLT4P35916 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms