Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6P35125 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6P35125 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP6P35125 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP6P35125 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP6P35125 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6P35125 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6P35125 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6P35125 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6P35125 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6P35125 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms