Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC1P33527 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms