Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms