Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms