Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX1P22670 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX1P22670 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX1P22670 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX1P22670 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms