Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms