Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL17P18621 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL17P18621 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL17P18621 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms