Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 RAD6YGL058W 519 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 TIM10YHR005C-A 282 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YKL066WYKL066W 444 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 HSP10YOR020C 321 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 ATX2YOR079C 942 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 ALG14YBR070C 714 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 BNR1YIL159W 4128 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 HAA1YPR008W 2085 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YDR239CYDR239C 2364 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 HYP2YEL034W 474 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YNL046WYNL046W 519 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SPC29YPL124W 762 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RRD2YPL152W 1077 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YLR001CYLR001C 2589 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SUL1YBR294W 2580 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RLF2YPR018W 1821 nt2.21□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SRO77YBL106C 3033 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 BCK1YJL095W 4437 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 NPR3YHL023C 3441 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RPS17BYDR447C 411 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RPL29YFR032C-A 180 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ERV1YGR029W 570 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YJR157WYJR157W 363 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 PBI2YNL015W 228 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RUF22RUF22 515 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 NSL1YPL233W 651 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 PUF4YGL014W 2667 nt2.2□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ESC1YMR219W 4977 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 GPI19YDR437W 423 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 COX13YGL191W 390 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YAP3YHL009C 993 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YLR379WYLR379W 375 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ISU1YPL135W 498 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 PDR3YBL005W 2931 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RPO41YFL036W 4056 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YNL034WYNL034W 1839 nt2.19□□□□□ -2.06
MSI1P13712 NEW1YPL226W 3591 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YIL166CYIL166C 1629 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RTR2YDR066C 591 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ADK1YDR226W 669 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 DDR48YMR173W 1293 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 snR43snR43 209 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RTT10YPL183C 3042 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 TRA1YHR099W 11235 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SEC26YDR238C 2922 nt2.18□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 DUG2YBR281C 2637 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 BNA7YDR428C 786 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 TSA2YDR453C 591 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RNR4YGR180C 1038 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SPC1YJR010C-A 285 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 CTK3YML112W 891 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YPL039WYPL039W 951 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YPL080CYPL080C 327 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ACM1YPL267W 630 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 IRC16YPR038W 360 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 POM152YMR129W 4014 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ASM4YDL088C 1587 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 MRD1YPR112C 2664 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YIL080WYIL080W 4722 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 DNL4YOR005C 2835 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 GPI17YDR434W 1605 nt2.17□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ISW1YBR245C 3390 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 TOP2YNL088W 4287 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SMY2YBR172C 2223 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 GLC7YER133W 939 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SGM1YJR134C 2124 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SYM1YLR251W 594 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RPS1AYLR441C 768 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 TOM22YNL131W 459 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YBL108WYBL108W 306 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YPL205CYPL205C 345 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 RLI1YDR091C 1827 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 FIR1YER032W 2631 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 KEL2YGR238C 2649 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 YKU80YMR106C 1890 nt2.16□□□□□ -2.06
MSI1P13712 ESL2YKR096W 3588 nt2.15□□□□□ -2.06
MSI1P13712 SSN2YDR443C 4263 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 NOP19YGR251W 591 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YHR130CYHR130C 336 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YJL007CYJL007C 315 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 PKR1YMR123W 369 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RGM1YMR182C 636 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 ECM5YMR176W 4236 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 UTP13YLR222C 2454 nt2.15□□□□□ -2.07
MSI1P13712 PSD2YGR170W 3417 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 IKI3YLR384C 4050 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 snR76snR76 109 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 IRC4YDR540C 540 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YER189WYER189W 369 nt2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms