Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAA2P0DJI9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAA2P0DJI9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms