Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms