Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NGFRP08138 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NGFRP08138 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NGFRP08138 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NGFRP08138 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NGFRP08138 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NGFRP08138 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NGFRP08138 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms