Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms