Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYBBP04839 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYBBP04839 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYBBP04839 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYBBP04839 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYBBP04839 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYBBP04839 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYBBP04839 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYBBP04839 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYBBP04839 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms