Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms