Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR2O75167 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms