Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms