Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B3O60423 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms