Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATCO43716 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATCO43716 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATCO43716 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATCO43716 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATCO43716 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATCO43716 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms