Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COCHO43405 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COCHO43405 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COCHO43405 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COCHO43405 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COCHO43405 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COCHO43405 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COCHO43405 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms