Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PER1O15534 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER1O15534 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER1O15534 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER1O15534 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER1O15534 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER1O15534 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PER1O15534 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER1O15534 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER1O15534 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER1O15534 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PER1O15534 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PER1O15534 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PER1O15534 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PER1O15534 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PER1O15534 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PER1O15534 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PER1O15534 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PER1O15534 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PER1O15534 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PER1O15534 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PER1O15534 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms