Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF6O14896 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF6O14896 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF6O14896 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF6O14896 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF6O14896 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF6O14896 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF6O14896 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF6O14896 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF6O14896 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF6O14896 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF6O14896 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF6O14896 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF6O14896 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF6O14896 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms