Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM223BA6NKX1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM223BA6NKX1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM223BA6NKX1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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