Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PALM3A6NDB9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PALM3A6NDB9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms