Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A8A0AV02 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A8A0AV02 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms