Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms