Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
THRAP3Q9Y2W1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms