Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms