Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms