Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF9BQ9UPX0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms