Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP18Q9UMW8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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