Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA11Q9UKX5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA11Q9UKX5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms