Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNL1Q9UK58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNL1Q9UK58 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms