Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSKSQ9UJT2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSKSQ9UJT2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSKSQ9UJT2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms