Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RABGEF1Q9UJ41 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RABGEF1Q9UJ41 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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RABGEF1Q9UJ41 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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