Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PUF60Q9UHX1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms