Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP68Q9UHB9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
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