Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC6Q9UBN7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms