Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG4Q9UBN1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms