Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms