Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms