Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DLL3Q9NYJ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms