Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms