Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms