Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4BQ9NPR2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms